Heiner übernahm das Amt im Oktober 1997, als der 1. FC Union Berlin sportlich wenig erfolgreich auftrat und sich in einer äußerst bedrohlichen finanziellen Lage befand. Der Präsident und seine Mitstreiter erreichten zunächst nach wirtschaftlicher Konsolidierung einen deutlichen Aufschwung, dem sich auch sportlicher Erfolg anschloss: So wurde der Klub im Jahr 2000 Meister der Regionalliga Nordost, er stieg im Jahr 2001 nach erneuter Regionalliga-Meisterschaft erstmals in die 2. Bundesliga auf, Union spielte im selben Jahr im DFB-Pokalfinale und erreichte im UEFA-Pokal-Wettbewerb die zweite Runde. Heiner wurde im Oktober 2003 durch den Aufsichtsrat des 1. FC Union Berlin abberufen.

Alles Gute, Heiner, herzliche Glückwünsche – Eisern Union!